Mise en relation des données hétérogènes chez l’espèce modèle Arabidopsis thaliana dans une base orientée graphe

Le choix de cette espèce modèle a été motivé par une bonne annotation du génome et l’abondance de données -omiques et phénotypique publiques. L’intégration de données a été réalisée avec Neo4j pour représenter les différents types de relations entre éléments génomiques. L’exploitation de cette base orientée graphe permet d’identifier des gènes candidats répondant aux critères recherchés.
En perspective, l’intégration de relation d’orthologie permettra d’inférer des gènes candidats chez d’autre espèces avec des approches de biologie translationnelle.